Nel 1640 il Teatro dell'Accademia degli Intrepidi è acquistato dal marchese Roberto degli Obizzi, che lo fa ristrutturare per trasformarlo in teatro d'opera. L’intervento, realizzato dall’architetto Carlo Pasetti, interessa esclusivamente la zona destinata al pubblico e consiste nella sostituzione delle gradinate con cinque ordini di pachettoni, mentre viene lasciata intatta la struttura aleottiana del palcoscenico.

Il Teatro degli Obizzi viene inaugurato nel 1660 in occasione dell'arrivo a Ferrara del Cardinale Frasone, nuovo legato pontificio, con La Dafne di Pio Enea degli Obizzi, favola in musica d’argomento mitologico, ricca di rimandi alla commedia dell’arte. Organizzatore, autore e attore di molte produzioni teatrali, Pio Enea degli Obizzi è un personaggio di primo piano nell’ambiente dello spettacolo e numerose sue opere vengono presentate a Ferrara come in altre città dell’Emilia e del Veneto. Dopo la sua morte, nel 1674, il Teatro degli Obizzi cessa ogni attività. È poi completamente distrutto da un incendio, forse di origine dolosa, nel 1679.